atlas and octave

これはメモです。情報が古い場合も、誤りである場合もありえます。

ほとんど, http://www.oishi.info.waseda.ac.jp/~oishi/FAQ/tani2.html の通りに作業しただけだが, メモがわりにここに書いておく.

Octave の 2.1 系からは, atlas の *.a ファイルを /usr/local/lib に置くだけで, make 時に勝手に探して組み込んでくれるそうだ. しかし, 2.1.44 などを make するには, readline を update しなくてはならないので, 面倒なのと, 2.0 系の安定性を買って, 2.0.17 を make. (2.1 系は FFT も良さそうなので, そのうち挑戦かな？)

1. Fortran のインストール

atlas の前に Fortran をインストール. Vine Linux 2.6 の場合, g77 は Vine Plus にある.

# rpm -i gcc-g77-2.95.3-2vl22.i386.rpm

2. atlas を make

% tar zxvf atlas3.4.1.tar.bz2
% cd ATLAS/
% make
(質問に答える. ほとんどデフォルト.)
% make install arch=Linux_UNKNOWN
(arch は, make 実行後に出るメッセージの通りにする.)

ここで, テストしてみる.

% make sanity_test arch=Linux_UNKNOWN

すると,

SCOPING FOR FAILURES IN CBLAS TESTS:
fgrep -e fault -e FAULT -e error -e ERROR -e fail -e FAIL \
        interfaces/blas/C/testing/Linux_UNKNOWN/sanity.out | \
                fgrep -v PASSED
make[1]: [sanity_test] エラー 1 (無視されました)
DONE
SCOPING FOR FAILURES IN F77BLAS TESTS:
fgrep -e fault -e FAULT -e error -e ERROR -e fail -e FAIL \
        interfaces/blas/F77/testing/Linux_UNKNOWN/sanity.out | \
                fgrep -v PASSED
make[1]: [sanity_test] エラー 1 (無視されました)
DONE
make[1]: 出ます ディレクトリ `/home/sasaki/app/atlas/ATLAS'

となって, テストは O. K. のよう.

3. octave を一旦 make

インストール先を /usr/local/octave-2.0.17 に

% tar zxvf octave-2.0.17.tar.bz2
% cd octave-2.0.17
% ./configure --prefix=/usr/local/octave-2.0.17
% make

4. atlas のライブラリを組み込み make

% cd (ソースツリーの場所)/ATLAS/lib/Linux_UNKNOWN/
% mkdir tmp
% cd tmp
% for i in ../*a
> do
> ar x $i
> done
% ar r (ソースツリーの場所)/octave-2.0.17/libcruft/libcruft.a *.o
% cd ..
% rm -r tmp
% cd (ソースツリーの場所)/octave-2.0.17/libcruft/lapack/
% g77 -O2 -c ilaenv.f
% cd ../..
% make
% su
# make install
# ln -s /usr/local/octave-2.0.17/bin/octave-2.0.17 /usr/local/bin/octave-atlas

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